ينقسم قسم المحاسبة الى عدة اقسام وهي:-
قسم المحاسبة العامة ويقوم بمتابعة الامور المالية التابعة للمستشفى بالاضافة الى متابعة العملاء و الموردين ، اما القسم الثاني فهو محاسبة الاطباء و يحتوي على الامور المالية التي تقوم المستشفى بتحصيلها من المريض و اعطائها للطبيب ، القسم الثالث وهو قسم محاسبة شركات التأمين وهو كما هو معروف فان المستشفى معتمد لدى العديد من شركات التامين ، القسم الاخير من اقسام المستشفى فهو قسم محاسبة المرضى و هذا القسم يقوم بالعمل على محاسبة المرضى بشكل سريع لتسهيل معاملة خروج المريض من المستشفى
